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波塞冬在维护知识产权的过程中除掉了科学败类利军和博古通今，从而彻底清除了科学发展史上最重要的绊脚石，亚特兰蒂斯王国的科技取得了突飞猛进的发展。手握三项专利权的彭诺，迅速在科学竞争中占到了主动地位，很快他建立了自己的科技公司，在改善国计民生方面取得了十分重要的战果。波塞冬邀请彭诺到他的宫殿里见面，彭诺带着几个助手进入了波塞冬的宫殿，他一眼就看到摆放在宫殿里面的13颗水晶头骨了，对此十分好奇。会见结束之后彭诺壮着胆子问波塞冬：“大王，这十三颗水晶头骨是干什么的？”
“这个我也不清楚！”波塞冬摇摇头说。“很久以前就放在这里，据传闻有9万年的历史了，据历代君主口耳相传知道，这个东西不能动，好像记载了我们的历史！”
“这么神奇？”彭诺惊呼道。“那我可以研究一下他们吗？”
“这个？”波塞冬有点儿犹豫，之前的君主一直嘱咐这个东西不能动，万一有所损坏得不偿失，不过彭诺是十分重要的科学家，给他研究一下也不是不可以，但是一定要小心。想罢波塞冬对着彭诺说：“你可以研究，不过不能拿离宫殿，也不能损坏！”
“嗯，那是一定！”彭诺有点儿欣喜若狂，他马上让助手带着各种仪器对水晶头骨进行了全方位的检测，不过可惜的是，除了对水晶做了确定之外什么信息也没得到，这些彭诺有些傻眼了，自己费尽心思搞出来的科学，竟然对眼前这个水晶头骨毫无作用。没办法只好四处请教有经验的人，可是周围人对水晶头骨都不了解，还是没什么进展。后来亚里听说了这件事之后专门找到彭诺说：“我听说你在研究水晶头骨？”
“嗯，是啊！”彭诺有些无奈地点点头，又突然振奋起来。“难道你知道怎么回事儿？”
“我也是听说！”亚里很谦逊地说。“原来在宫殿里藏着几把激光剑，听说激光剑能够解开水晶头骨里的秘密，不过那些激光剑快要烂完了！”
“我可以去看看吗？”彭诺请求道。
“应该可以，那些激光剑由一个退役的老兵看守呢，好像也没有什么人打那些激光剑的主意！”
“那我去看看！”
“好，我带你去！”亚里说着带着彭诺和他的几个助手来到了宫殿后面的仓库，地方不小，就一个老军在这儿看着，看着亚里来了刚忙施礼：“亚里大人，你过来有什么要视察的？”
“啊，老人家，之前放在仓库里面的激光剑还在吗？”亚里很礼貌地问道。
“啊，都在呢，不过就剩下一些残渣了，已经面目全非了！”老军解释道。
“哦，我去看看！”
“嗯，我带你们去！”老军说着带着亚里和彭诺等人来到仓库的后院，在一个很不显眼的地方找到了那几柄激光剑。彭诺一看十分失望，眼前只剩下一些破铜烂铁的残骸，除此之外什么信息都没有。
“不知道亚里大人看这些废铜烂铁干什么？”老军在一旁好奇的问道。
“不是我要看，是这位科学家要看，他想解开水晶头骨的秘密！”亚里指了指旁边的彭诺，彭诺朝老军点点头。
“哦，是这样！”老军若有所思地点点头。“如果你们想解开水晶头骨的秘密，你们可以到基地去看看，听说那里有很多灵异事件！”
“基地，什么基地？”彭诺有些疑惑地问道。
“基地呢，就是传闻中，我们的祖先在地球上登陆的地方，他们的飞行器就落在那里，虽然已经烂成碎末了，有些物质的性质还在，所以那个地方经常会发生一些我们现在的科学很难解释的事情！”亚里解释说。
“嗯，我去看看！”彭诺有点儿迫不及待地说。
“也好，我让一个科学团队陪你去，他们近期也在研究这个！”亚里说道。
“你们真的要去基地啊？”一旁的老军吃惊的说。
“是啊！”彭诺肯定的点了点头。
“那你们可千万不要靠近那个飞行器的残骸，会有可怕的事情发生的！”老军苦口婆心地嘱咐道。
“可怕的事情？”彭诺疑惑地问老军。“什么可怕的事情？”
“是啊，是一种怪病，任何部位都可能患病，而且必死无疑！”老军认真的说。
“有这么严重？”彭诺有些怀疑。
“千真万确！”老军又重复了一遍。
“那好吧，我们听你的就是了！”彭诺答应着跟着亚里出来仓库，很快亚里就把要去基地考察的科学团队介绍给了彭诺。领队的是一个叫德西的心理学医生，他们最近接触到的一些病人去过基地，回来之后便换上了怪病，医生们一时束手无策，德西决定带领这些人到基地一探究竟。很快彭诺和德西带着一个科学团队来到基地，其实这里面什么都没有了，只是一片空地，周围有几座小山包，空地上斑斑点点，有的地方植被非常茂盛，有的地方什么也没有，植被覆盖成一个模糊的飞船形状。德西一看是这里了，十分兴奋，当时就想过去好好看看。彭诺一把拉住了他：“别去，那里很危险！”
“不去看看怎么查明患者的病因？”德西十分认真地说。
“你也知道，那些患者就是因为从这里走过才患病的，如果你去，那患病的就是你了！”彭诺解释说。
“那我们现在怎么办？”
“我们现在外围观察一下，等足够了解了再靠近！”彭诺谨慎地说。
“那好吧！”德西也不勉强，按照彭诺的要求在基地周围的小山包上观察基地的情形，一开始还可以忍受，后来实在没耐心了，他决定到基地中心亲身看一看。彭诺眼看拦不住只好说：“这样吧，今天先休息一下，明天我和你一起到基地中心走一走！”
“这个？”德西一看彭诺这么说了，也不好剥了他的面子，也就点头答应了。当晚科学团队在小山包上露宿，大家在空地上点燃一堆篝火，一边吃东西一边纷纷议论这基地的情况。有个队员东西吃多了，到一旁去方便，突然他两眼朝基地的方向看了一眼。这一眼可把他吓了一大跳，就看见基地没有植被覆盖的五个地方，五道光束直冲云霄，虽然强度不是很大，范围确实不小，把附近一些地方都照亮了。这名队员不敢怠慢，赶紧收拾一下来到火堆旁向彭诺和德西报告：“队长，我刚才看到十分诡异的情况，基地中心五块空地射出五道光束来，把周围都照亮了！”
“你说什么？五道光束？”彭诺惊奇的问了一遍。
“没错，就在基地上空呢！”队员肯定的说。
“你不会是看花了眼了吧？”德西有些怀疑，因为在心理学上经常发生这样的事。
“不会，我看一会儿，都没有变！”队员说的十分肯定。
“走，我们去看看！”德西立即站起了身子，紧跟着彭诺也站立起来，大家跟着他们两个朝基地方向走去。很快他们就来到刚才那个队员方便的地方，人群中爆发出一阵惊呼，果然大家看到了五道光束。
“难道这里面还有人？”德西怀疑地自言自语。
“不会，这好像不是人为的！”彭诺肯定的说。
“那这是怎么回事儿？”德西一时间摸不着头脑。
“也许这里面有些特殊的物质，我们还不了解他们的性质，甚至可以推测，这很有可能就是我们的祖先来到地球上的时候，他们的飞行器没有释放完的能量！”彭诺推测着说。
“嗯，那现在怎么办？要不要到基地中心看一看？”德西征求彭诺的意见。
“千万不要，之前那些患了怪病的人，很有可能就是这些不明光束造成的，现在过去等于自寻死路！”彭诺肯定的说。
“那我们就这样放弃对病因的考察了？”德西心有不甘。
“那倒不是，我们得先了解这几束光线性质，否则遗患无穷！”
“了解这几束光线的性质，这谈何容易啊？”德西抱怨道。
“我们可以去问国王波塞冬！”彭诺诡异地一笑。
“问他？他不是个科学家啊？”德西疑惑地问。
“那没关系，只要知道我们的国王敬重科学就行了，他可以开启民智，我们一起来解决这个问题就行了！”彭诺十分乐观的说。这个解决问题的方法还真让他找对了，科学团队回到亚特兰蒂斯王国的都城之后，报这件事报告了波塞冬。波塞冬很快就发出布告，向全国征求解决问题的人，很快就有了回复，一个叫波里的年轻科学家正在研究这方面的问题，他发现了一种能够发出光线的矿物质，并给这种现象取名放射性，这种射线能够使胶片感光，能够让人和动物产生疾病。于是亚特兰蒂斯人在研究微观方面有了一个里程碑式的成就，接着人们对微观世界的认识就像井喷一样，很快人们就了解了原子的构成，再之后又发现了电磁波，认识到了质能关系。这让彭诺十分兴奋，没多久他就恢复了激光剑的功能，进而解开了水晶头骨里面秘密。从破译出的信息他了解到，他们的祖先来到地球上是依靠放射性元素发出的能量持续飞行，这过程中质量会亏损，亏损的质量转化成了能量，这就是质能关系。根据这个原理，彭诺说服波塞冬开发核能，没多久亚特兰蒂斯人就拥有了核电站和核武器。
彭诺在核领域取得了重大突破之后并不满足于现状，因为根据质能关系的推导，质量能够转化成能量，那么能量也就能够转化成质量。质量转化成能量需要一个引发过程，就是靠离子轰击，那么能量转化成质量靠什么呢？彭诺想来想去觉得电和磁比较靠谱，经过多次试验之后，最终他找到了能够把能量转化成质量的方法，就是强磁感应。得到实验成果之后，彭诺把这个消息报告了波塞冬，要求波塞冬以国家的力量做一次实验，先把质量转化成能量，然后把能量以光速传递过去，然后在转化成质量，这样就实现了瞬间移动。波塞冬二话没说就答应了，很快便准备好了实验所需要的一切条件，不过比较头疼的是，始终没有人担当这次实验的志愿者，最后彭诺无奈了，那就拿我来做实验吧。这时候波塞冬拦住了他：“这个实验的危险性还是比较高的，如果失败那就回不来了，你可是重要的科学家，这么做不妥！”
“那实验该做了也得做，我不能让国家费了这么多的物力财力一无所获！”彭诺悲怆地说。
“这样，我来！”波塞冬很坚定的说。
“这怎么可以呢？”彭诺反对道。
“是啊，要不我替你吧！”一旁的亚里也走了过来。
“不行，我既然说了要来，那就我来！”说完波塞冬很从容地走到了强磁发射器中央，彭诺小心的启动设备，磁场逐渐加强，波塞冬开始有些不适，但他还是硬挺住了，并示意彭诺继续。在磁场加大到最大的那一瞬间，波塞冬突然就消失了，彭诺吓了一跳，亚里也十分吃惊，他们赶紧按照设定的路径赶紧去寻找，果然在五公里之外找到了完好无损的波塞冬，这下把大家乐坏了，原来瞬间移动真的能够实现啊，从此之后波塞冬成为亚特兰蒂斯王国第一个能够瞬间移动的人。
与彭诺的成功相比，德西的贡献丝毫不逊色，自从发现了电磁波之后，德西就开始研究大脑，很快他就发现了脑电波。他知道，如果一个人靠眼睛去识别物体，那么人只能看见光线射入人眼的物体，因为光是沿着直线传播的，稍微拐个弯，人就看不见了，这是视觉的局限，有了脑电波就不一样了，如果人能够接手脑电波信号，那我们就不只能看到直线上的物体了，拐个弯也没什么问题。德西很快就把想法付诸实践了，很快就取得了成果，但是这个成果并不理想，德西反复试验了好几次还是没什么进步。无奈之下只好把这件事告诉了波塞冬，波塞冬上次试验尝到了甜头，这次也想试试，于是立马答应试验，不过这次实验很不理想，他并没有获得预期的特异功能。德西冥思苦想了之后说：“大王，试验不成功的原因也许你我都是成年人，我们的各个器官都不那么灵敏了，如果从婴幼儿开始培养，那估计就能实现了！”
“这个容易，把我的儿子叫过来，任由先生摆布！”波塞冬十分大方地说。其实之前波塞冬在一个小岛上认识了一位父母双亡的少女，波塞冬娶了这位少女并生了五对双胞胎，长子就是亚特拉斯，当时只有十岁。波塞冬把他叫过来，让德西进行培养，结果德西不负众望，一年之后就教会了亚特拉斯透视的能力。从此亚特拉斯就成为了波塞冬的接班人，波塞冬把亚特兰蒂斯划分为十个区，分别让十个儿子统治，长子为最高统治者。
波塞冬死后，亚特拉斯继承了王位，他在亚特兰蒂斯大陆中央建立了卫城，卫城有给波塞冬和他的妻子的庙宇以及祭祀波塞冬的神殿，神殿内部有金银、黄铜和象牙的装饰。海岸边设有造船厂，船坞内挤满了三段浆的军舰，码头内部有来自世界各地的商船和商人。
10位国王在自己的领土内握有绝对权力，各自采行不同的国家组织，彼此间保持沟通，每隔五到六年，在波塞冬神殿齐聚一堂，讨论彼此的关系及其统治权力，当协议成立后就割断饲于波塞冬神殿中的母牛喉部，以其血液在波塞顿神殿的柱子上写下决议条文，以增添决议神圣不可侵犯的权威性。
随着时光逝去，到了亚特拉斯晚年，亚特兰蒂斯王国固有的崇高思想日渐淡薄，终于有一天，他们的军队越过直布罗陀海峡，开始侵略别国。他们首先征服了埃及和叙利亚，来自这两个地方的贡品源源不断地运往亚特兰蒂斯大陆，尝到侵略甜头的亚特兰蒂斯人开始进攻雅典，古雅典人十分英勇，他们凭借原始的武器，经过激战之后击退了亚特兰蒂斯人的军队，这让亚特拉斯十分愤怒，他们的军队屡次在这里碰钉子，这次他下定决心把雅典从地球上抹掉，于是他准备动用核武器。当时的雅典还处在原始社会后期，科技实力相对比较落后，如果亚特拉斯真的动用核武器，那雅典就不存在了。就在这时候，亚特拉斯派去南下的部队回来报告道：“我们在南下过程中遇到了极其诡异的一幕！”
亚特拉斯一听就是呆呆的一愣！